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基因文库平台

平台简介

基因文库平台是由生命科学联合中心资助的非仪器类平台,归属清华大学生物医学测试中心共享仪器平台管理,位于生物技术馆1-102A室,自2014年5月正式对校内师生提供开放服务。基因文库平台主要提供human和 mouse全基因组shRNA干扰文库及CRISPR基因编辑文库,为清华大学基因编辑相关研究的课题组提供便利和支持。

shRNA干扰文库包括Custom Glycerol-human shRNA library(人类全基因组shRNA干扰文库)和Custom Glycerol-mouse shRNA library(小鼠全基因组shRNA干扰文库),涵盖46802个genes,247661个clones。

CRISPR基因编辑文库由SANGER HUMAN CRISPR LIBRARY(GLY)和SANGER MOUSE CRISPR LIBRARY(GLY)组成,含克隆75,040个,基因数37,520个。

基因文库平台所有样本以甘油菌形式保存,日常由专业人员运行和维护,根据课题组的需求可在最短时间内提供列表中所涵盖的文库材料,其目的及意义旨在保证高效、特异结果的基础上,降低用户的时间成本和经济成本。


shRNA干扰文库

一、 文库列表

1. Custom Glycerol-human shRNA library(人类全基因组shRNA干扰文库)

2. Custom Glycerol-mouse shRNA library(小鼠全基因组shRNA干扰文库)

二、 基因及克隆数量


备注:在我们提供的文库总表中已标记了某个克隆是否已被验证。

三、 载体信息

TRC1.5 Vector:pLKO.1-puro Vector

TRC2 Vector:TRC2-pLKO-puro Vector

四、 病毒包装系统

目前实验室采用的病毒包装质粒是:pΔ8.9,Vsv-G和shRNA plasmid。产毒用的细胞是293FT。供大家参考。平台暂无法提供病毒包装质粒。

五、Control信息


注: TRC1.5 control对TRC1.0同样适用。

六、  补充说明

文库中平均每个基因对应3-5个克隆。据公司介绍,理论上每个基因至少有一个克隆干扰效率能达到70%(mRNA水平)。但我们无法确保都会有效,如果在使用过程中出现问题请反馈给我们,我们会协助与公司进行沟通。

关于shRNA干扰文库更详细的介绍见网址:http://www.sigmaaldrich.com/china-mainland/zh/life-science/functional-genomics-and-rnai/shrna.html

CRISPR基因编辑文库

一、 文库列表

1. SANGER HUMAN CRISPR LIBRARY, GLY

2. SANGER MOUSE CRISPR LIBRARY, GLY

3. 亚文库参考表单

二、 基因及克隆数量

三、 载体信息
Lentiviral Vectors

四、Cas9 Proteins
需要与cas9配合使用。可选择cas9的表达质粒,或cas9蛋白。

注:CAS9PROT需自行订购,网址参考:https://www.sigmaaldrich.com/catalog/product/sigma/espcas9pro?lang=zh®ion=CN

五、  Control信息

如下三种不同的阴性对照质粒的载体同本文库中的慢病毒载体 (LV04 vector)一致。三者的区别是仅gRNA序列不同,序列信息如下。三个gRNA 均不靶向人、小鼠和大鼠的任何基因。

六、补充说明

CRISPR基因编辑文库平均每个基因对应2个克隆,以保证敲除效率。但我们无法确保都会有效,如果在使用过程中出现问题请反馈给我们,我们会协助与公司进行沟通。

关于CRISPR基因编辑文库更详细的介绍见网址:https://www.sigmaaldrich.com/life-science/functional-genomics-and-rnai/crispr-cas9-gene-editing.html

使用申请
1. 使用人在平台提供的文库总表中找出所需的克隆信息并E-mail至gxyq@mail.tsinghua.edu.cn;同时填写文库使用申请单并打印签字后交给管理员;
2. 由管理员找出克隆给使用人(每个克隆提供约0.5ml的菌液);
3. 定期由基因文库平台负责和各课题组结算。
联系我们
联系人:

连佳欢 冯倩倩

电话:

62798144/62798389

邮箱:

fengqq@mail.tsinghua.edu.cn

地址:

清华大学生物技术馆1-102A室

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